服务背景
细胞上清液作为细胞体外培养的直接微环境,其中富含细胞分泌或代谢产生的多种小分子物质,如氨基酸、脂质、糖类、核苷酸及信号分子等。这些代谢物的种类和丰度变化直接反映了细胞在特定条件下的生理状态、应激反应、药物处理效果以及疾病相关机制。随着质谱技术与生物信息学的发展,基于高通量的细胞上清代谢组学分析应运而生,为系统解析细胞功能、发现新型生物标志物及药物靶点提供了强有力的工具。
服务挑战
1. 样本基质复杂: 细胞培养基中含有高浓度的盐分、酚红、血清蛋白及缓冲成分,严重干扰微量代谢物的检测,需有效的样本前处理方案。
2. 代谢物浓度低: 许多关键代谢物(如神经递质、激素类)分泌量极微,对检测平台的灵敏度要求极高。
3. 代谢物稳定性差: 部分代谢物在常温或反复冻融下易降解,导致结果偏差,需严格的样本采集与保存流程。
4. 数据解析困难: 产生的大量高维数据需要专业的生物信息学工具和数据库进行定性、定量及通路富集分析。
服务内容
1. 实验设计与优化: 协助客户确定合理的对照组、处理组、样本量及收集时间点。
2. 样本前处理: 开发并优化针对细胞上清的去蛋白、除盐、萃取等定制化前处理流程。
3. 代谢物检测: 采用超高效液相色谱-串联质谱(UHPLC-MS/MS)平台,提供:
· 非靶向代谢组学: 全面扫描,发现差异代谢物,适合探索性研究。
· 靶向代谢组学: 对特定代谢物进行绝对定量,灵敏度高、重现性好。
4. 数据处理与分析: 包括峰识别、对齐、归一化、缺失值填充;多元统计分析(PCA、PLS-DA、OPLS-DA);差异代谢物筛选;KEGG通路富集分析及生物功能注释。
5. 个性化报告: 提供详细的中英文实验报告和可视化的分析结果图表。
仪器设备:液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)
服务范围
· 药物研发: 评估候选药物对细胞代谢的影响及潜在毒性。
· 肿瘤研究: 探索肿瘤细胞代谢重编程、耐药机制及肿瘤微环境中的代谢交流。
· 免疫学: 分析免疫细胞激活、分化和效应阶段的代谢需求与特征。
· 干细胞与再生医学: 监测干细胞培养过程中的代谢状态,优化分化条件。
· 毒理学: 通过代谢物变化快速筛查环境污染物或化学品的细胞毒性。