服务挑战
序列解析的准确性受限。 蛋白从头测序依赖于MS/MS数据的b/y离子信号强度，然而在实际实验中，离子信号可能不完全，导致序列覆盖度下降。
复杂样本的测序难度大。 生物样本通常由多个蛋白组成，存在高度复杂的蛋白质组成和动态范围。低丰度蛋白的检测常受到高丰度蛋白的干扰，影响从头测序的灵敏度。
翻译后修饰（PTMs）的干扰。 PTMs（如磷酸化、糖基化、乙酰化等）会改变肽段的质谱碎裂模式，影响b/y离子的产生及其分布。当修饰类型与位点未知时，传统分析方法难以覆盖所有可能性。
服务内容
1. 全序列测定。 对目标蛋白进行完整的氨基酸序列解析，实现从N端到C端的全长序列拼接。可实现对所测定靶蛋白序列的高覆盖率测定。
2. 翻译后修饰（PTMs）分析。 识别并定位蛋白质上的各类翻译后修饰，包括磷酸化、糖基化（N-型、O-型）、甲基化、乙酰化、氧化、脱酰胺等。无需预设修饰类型，通过质量偏移直接定位修饰位点。
3. 突变与变异分析。 识别非同义突变、氨基酸替换、微小插入缺失及融合蛋白等结构信息。突变蛋白或融合蛋白常因单个氨基酸变化无法被数据库识别，De Novo技术能直接在质谱层面捕捉这些突变位点。
4. 抗体序列解析。 针对单克隆抗体、多克隆抗体提供重链与轻链的完整氨基酸序列测定，特别是CDR（互补决定区）区域的精准还原。
仪器设备：液相色谱-串联质谱仪等。
服务范围
1. 抗体药物研发。 用于杂交瘤或噬菌体展示抗体的序列解析，支持结构优化与专利规避。在抗体人源化与亲和力成熟中提供精确序列模板。对于已丢失表达载体的老抗体，可直接从蛋白还原轻链/重链结构。
2. 非模式生物与未知物种研究。 在植物、微生物、海洋生物、中药活性成分等研究中，蛋白质组数据库普遍存在缺失或注释不全的情况。De Novo测序适用于新物种、新组织、新状态下的蛋白质表达探索。
3. 生物药质量控制与一致性验证。 比较不同批次、不同表达系统（如CHO与HEK293）下蛋白结构的一致性，识别显著突变及糖基化、氧化、异构体等微观修饰差异。
