小核酸序列分析服务

提供分子量测定、序列确认、寡核苷酸纯度分析、完整分子量和MS2分析进行定性确认等检测,适用于小干扰RNA(siRNA)、反义寡核苷酸(ASO)、微小RNA(miRNA)、核酸适配体(Aptamer)、piRNA、ncRNA等。

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服务背景

高通量测序技术为小RNA研究提供了强有力的工具。随着多款siRNA、ASO药物陆续获批上市,小核酸药物已成为全球生物医药领域的热点方向。与此同时,人工智能技术的迅速发展为核酸药物设计提供了新的思路和技术手段,在序列优化、结构预测、性质评估以及递送系统改进等方面展现出显著潜力。基于AI算法的序列设计平台可在3天内完成siRNA或ASO序列的初步设计。

服务挑战

序列设计与优化难度大。 设计小核酸药物需要考虑其与非靶向基因的非特异性结合及可能出现的脱靶效应。由于许多mRNA具有不同的转录本,必须仔细研究其不同之处,以避免剪接时靶基因序列的漏失。每一个核苷酸不仅影响碱基配对,还影响RISC加载动力学、脱靶效应和免疫原性。

化学修饰增加分析难度。 寡核苷酸药物常采用硫代磷酸酯(PS)、2'-OMe、2'-F、吗啉取代(PMO)、GalNAc偶联等多种化学修饰以提升稳定性与靶向性,但这些修饰也显著增加了结构确证的难度。

杂质分析极具挑战。 合成过程中产生的failure序列、截短片段等杂质与目标产物性质相近,分离难度较大。寡核苷酸分子带有大量负电荷、极性较强,在传统反相色谱柱上保留较差,且容易形成二级结构,影响分离效果。

法规要求日益严格。 需遵循国内外监管机构(NMPA/EMA)的严苛指南要求,采用多种正交分析方法进行全面表征。

服务内容

序列确认与质量分析

· 分子量测定、序列确认

· 寡核苷酸纯度分析

· 完整分子量和MS2分析进行定性确认

仪器设备:液质色谱联用仪等。

服务范围

小干扰RNA(siRNA)、反义寡核苷酸(ASO)、微小RNA(miRNA)、核酸适配体(Aptamer)、piRNA、ncRNA等

常见问题解答

小RNA测序对样品有什么要求?
总RNA建议起始量≥3 μg,浓度≥200 ng/μl,OD260/OD280介于1.8-2.2之间。提取总RNA时请避免使用过柱法和LiCl沉淀法,以避免Small RNA的丢失。样品保存期间切忌反复冻融。
服务周期需要多久?
标准小RNA测序项目周期约为45个工作日。AI序列设计服务最快3天起,序列合成4天起。
可以分析哪些类型的小RNA? 可以分析miRN
siRNA、piRNA、snRNA、snoRNA、rRNA等多种类型的小RNA,以及植物特有的24-nt siRNA、phasiRNA和natsiRNA。

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